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澳门威尼斯人官方游戏:他们估计全球传播的开始回升的时间从1月下旬到2月中旬

时间:2020/5/31 10:02:46   作者:   来源:   阅读:5   评论:0
内容摘要:枝散在,未按国家或地理区域分组。尽管起源不同,但这一分支中的许多序列非常相似或相同,这使得在没有其他流行病学数据的情况下,无法解决病例之间的直接关系或方向性。接下来,研究人员使用ML和贝叶斯系统动力学分析来推断与纽约市相关的新冠传播事件的时间。为进化枝负责,他们估计全球传播的开始...
枝散在,未按国家或地理区域分组。尽管起源不同,但这一分支中的许多序列非常相似或相同,这使得在没有其他流行病学数据的情况下,无法解决病例之间的直接关系或方向性。接下来,研究人员使用ML和贝叶斯系统动力学分析来推断与纽约市相关的新冠传播事件的时间。

为进化枝负责,他们估计全球传播的开始回升的时间从1月下旬到2月中旬,符合流行病学的观察流行发展)。最早的序列的底部,负责进化枝包括隔离从意大利、芬兰、西班牙、法国、英国和其他欧洲国家自2月下旬以来,以及一些北美隔离(加拿大和美国)从3月的第一个星期。在这一分支中,研究人员发现了两种突变,以将它们与纽约市和其他地区的序列簇区分开来,这表明至少有两种独立的病毒引入可能发生在2月初到2月中旬之间。

值得注意的是,这两个集群中的一个包含了位于clade A2a的72个纽约市分离株中的64个,这表明了社区传播的发生。

与clade A2a相似,clade A1a中的SARS-CoV-2分离株(6%)分散在多个方向未知的区域该clade也主要由欧洲来源的分离株(82%)组成,具体见图2B。

对于剩下的分支(B、B1和B4),研究人员确定了4个SARS-CoV-2菌株,它们从2月到3月初被引入纽约。值得注意的是,根据其与美国其他分离株的密切关系,包括在华盛顿州引起主要社区传播的分离株),可以推断其中两种来自美国。最近有报道说这一分支的菌株被引入了美国东海岸(纽约位于东海岸)。尽管B分支中超过一半的序列起源于亚洲,但与纽约分离株最接近的序列起源于欧洲和北美。

上述测序分离物和支链在地理上分布于纽约市所有行政区和21个社区,这与纽约其他医院的测序分离物和支链的时空分布类似。

综上所述,研究结果表明,纽约SARS-CoV-2的流行主要来自于美国和欧洲之间的未追踪传播,病原体直接从中国引进的证据非常有限。

虽然2020年4月初获得的SARS-CoV-2基因序列相对较少,但研究发现了位于clade A2a内的两个单系病毒簇,其中几乎完全包含来自纽约的分离株)。一个聚类包括23%(17)分离出的clade A2a和总测序分离出的20%。根据邮政编码信息,集群的病例分布在五个县,包括样本新罗谢尔在威彻斯特县,是市区的一部分,据纽约和北社区获得性感染组的最早记录在国家报道3月3日,2020年。该簇在ORF1b基因中以氨基酸取代A1844V为特征。这些病毒群的基础是从明尼苏达州、华盛顿州和加利福尼亚州分离出来的。纽约分离病毒与美国其他分离病毒之间的相关性表明,本地传播的病毒可能是通过国内途径传入纽约的。

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